MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 4537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187147	GC	3	6	224	229	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
2	NT_187147	TCG	2	6	231	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995010
3	NT_187147	CCA	2	6	239	244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995010
4	NT_187147	CG	3	6	262	267	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
5	NT_187147	GCG	2	6	294	299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995010
6	NT_187147	GCGG	2	8	351	358	0 %	0 %	75 %	25 %	399995010
7	NT_187147	GTC	2	6	404	409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995010
8	NT_187147	GCC	2	6	462	467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
9	NT_187147	GAC	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
10	NT_187147	CGA	2	6	507	512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
11	NT_187147	GCC	2	6	556	561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
12	NT_187147	CG	3	6	594	599	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
13	NT_187147	GCA	2	6	609	614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
14	NT_187147	GCC	2	6	673	678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
15	NT_187147	CCG	2	6	706	711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
16	NT_187147	ATC	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995010
17	NT_187147	CAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995010
18	NT_187147	GC	3	6	908	913	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
19	NT_187147	GGC	2	6	931	936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
20	NT_187147	CGGC	2	8	969	976	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
21	NT_187147	GGC	2	6	1072	1077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
22	NT_187147	AAC	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995011
23	NT_187147	CTT	2	6	1135	1140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995011
24	NT_187147	TCG	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995011
25	NT_187147	CGG	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
26	NT_187147	CGA	2	6	1260	1265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995011
27	NT_187147	GCG	2	6	1333	1338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
28	NT_187147	GCC	2	6	1367	1372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995011
29	NT_187147	CGT	2	6	1393	1398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995011
30	NT_187147	CGG	2	6	1405	1410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
31	NT_187147	CCA	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995011
32	NT_187147	GCG	2	6	1458	1463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
33	NT_187147	CAG	2	6	1603	1608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995011
34	NT_187147	GAT	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995011
35	NT_187147	GC	3	6	1619	1624	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
36	NT_187147	GCG	2	6	1638	1643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
37	NT_187147	TGA	2	6	1656	1661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995011
38	NT_187147	TCGG	2	8	1682	1689	0 %	25 %	50 %	25 %	399995011
39	NT_187147	TCA	2	6	2039	2044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995012
40	NT_187147	TG	3	6	2063	2068	0 %	50 %	50 %	0 %	399995012
41	NT_187147	GC	3	6	2081	2086	0 %	0 %	50 %	50 %	399995012
42	NT_187147	CCG	2	6	2321	2326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
43	NT_187147	CAT	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
44	NT_187147	GA	3	6	2446	2451	50 %	0 %	50 %	0 %	399995013
45	NT_187147	GGC	2	6	2454	2459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
46	NT_187147	GC	3	6	2546	2551	0 %	0 %	50 %	50 %	399995013
47	NT_187147	ATC	2	6	2605	2610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
48	NT_187147	TCC	2	6	2710	2715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995013
49	NT_187147	TCA	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
50	NT_187147	GCG	2	6	2760	2765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
51	NT_187147	GCA	2	6	2819	2824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
52	NT_187147	TCG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
53	NT_187147	TTG	2	6	2902	2907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
54	NT_187147	TTC	2	6	2920	2925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995013
55	NT_187147	TGA	2	6	2948	2953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995013
56	NT_187147	TGC	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
57	NT_187147	GTT	2	6	2979	2984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
58	NT_187147	CCA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995013
59	NT_187147	CGAG	2	8	3042	3049	25 %	0 %	50 %	25 %	399995013
60	NT_187147	TCG	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
61	NT_187147	ACG	3	9	3241	3249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
62	NT_187147	GCG	2	6	3265	3270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
63	NT_187147	CCT	2	6	3281	3286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995013
64	NT_187147	GA	3	6	3337	3342	50 %	0 %	50 %	0 %	399995013
65	NT_187147	CCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
66	NT_187147	CGGCC	2	10	3366	3375	0 %	0 %	40 %	60 %	399995013
67	NT_187147	CGC	2	6	3452	3457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
68	NT_187147	CGG	2	6	3494	3499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
69	NT_187147	A	6	6	3508	3513	100 %	0 %	0 %	0 %	399995013
70	NT_187147	CGA	2	6	3514	3519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
71	NT_187147	GCC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
72	NT_187147	CAG	2	6	3597	3602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
73	NT_187147	GTG	2	6	3622	3627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995013
74	NT_187147	CGG	2	6	3629	3634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
75	NT_187147	ATC	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
76	NT_187147	GCC	2	6	3694	3699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
77	NT_187147	CAG	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
78	NT_187147	GGT	2	6	3771	3776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995013
79	NT_187147	ACC	2	6	3832	3837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995013
80	NT_187147	TTG	2	6	3856	3861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
81	NT_187147	CAG	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
82	NT_187147	CCGG	2	8	3917	3924	0 %	0 %	50 %	50 %	399995013
83	NT_187147	TG	3	6	4240	4245	0 %	50 %	50 %	0 %	399995014
84	NT_187147	CGT	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995014
85	NT_187147	CGT	2	6	4295	4300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995014
86	NT_187147	CGC	2	6	4338	4343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995014
87	NT_187147	AGG	2	6	4358	4363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995014
88	NT_187147	GC	3	6	4440	4445	0 %	0 %	50 %	50 %	399995014
89	NT_187147	GTC	2	6	4575	4580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
90	NT_187147	CTG	2	6	4607	4612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
91	NT_187147	TCA	2	6	4615	4620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995015
92	NT_187147	CTG	2	6	4629	4634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
93	NT_187147	TGC	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
94	NT_187147	TCG	2	6	4711	4716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
95	NT_187147	GC	3	6	4728	4733	0 %	0 %	50 %	50 %	399995015
96	NT_187147	TTCG	2	8	4743	4750	0 %	50 %	25 %	25 %	399995015
97	NT_187147	GCAG	2	8	4791	4798	25 %	0 %	50 %	25 %	399995015
98	NT_187147	CGC	2	6	4826	4831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995015
99	NT_187147	TGA	2	6	4840	4845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995015
100	NT_187147	CTG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
101	NT_187147	GGC	2	6	4865	4870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995015
102	NT_187147	GGCT	2	8	4884	4891	0 %	25 %	50 %	25 %	399995015
103	NT_187147	GAC	2	6	4892	4897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995015
104	NT_187147	CAA	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995015
105	NT_187147	TGA	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995015
106	NT_187147	CGG	3	9	4987	4995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995015
107	NT_187147	AAG	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995015
108	NT_187147	CTG	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
109	NT_187147	TCG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
110	NT_187147	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995016
111	NT_187147	GGC	2	6	5151	5156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
112	NT_187147	GGC	2	6	5188	5193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
113	NT_187147	CGG	2	6	5197	5202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
114	NT_187147	TCT	2	6	5260	5265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995016
115	NT_187147	GCA	3	9	5278	5286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995016
116	NT_187147	CCGC	2	8	5313	5320	0 %	0 %	25 %	75 %	399995016
117	NT_187147	CGA	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995016
118	NT_187147	CCA	2	6	5386	5391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995016
119	NT_187147	TCG	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
120	NT_187147	CG	3	6	5532	5537	0 %	0 %	50 %	50 %	399995016
121	NT_187147	CGCT	2	8	5540	5547	0 %	25 %	25 %	50 %	399995016
122	NT_187147	CGT	2	6	5578	5583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
123	NT_187147	CTG	2	6	5732	5737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
124	NT_187147	GCC	2	6	5741	5746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995016
125	NT_187147	CG	3	6	6027	6032	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
126	NT_187147	GC	3	6	6043	6048	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
127	NT_187147	GATG	2	8	6093	6100	25 %	25 %	50 %	0 %	399995017
128	NT_187147	CG	3	6	6111	6116	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
129	NT_187147	GCC	2	6	6151	6156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995017
130	NT_187147	GACA	2	8	6172	6179	50 %	0 %	25 %	25 %	399995017
131	NT_187147	GC	3	6	6190	6195	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
132	NT_187147	TGC	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995017
133	NT_187147	GAC	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995018
134	NT_187147	GCCG	2	8	6587	6594	0 %	0 %	50 %	50 %	399995018
135	NT_187147	TCA	2	6	6619	6624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995018
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142	NT_187147	T	6	6	6919	6924	0 %	100 %	0 %	0 %	399995018
143	NT_187147	ATCA	2	8	7040	7047	50 %	25 %	0 %	25 %	399995018
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260	NT_187147	TCT	2	6	14459	14464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995031
261	NT_187147	GAT	2	6	14550	14555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995031
262	NT_187147	CGC	2	6	14556	14561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995031
263	NT_187147	GCCG	2	8	14630	14637	0 %	0 %	50 %	50 %	399995031
264	NT_187147	CG	3	6	14678	14683	0 %	0 %	50 %	50 %	399995031
265	NT_187147	ATG	2	6	14704	14709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995031
266	NT_187147	GCT	2	6	14753	14758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995031
267	NT_187147	ATC	2	6	14817	14822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995031
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270	NT_187147	CGG	2	6	15401	15406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995032
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272	NT_187147	GC	3	6	15480	15485	0 %	0 %	50 %	50 %	399995032
273	NT_187147	CGG	2	6	15518	15523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995032
274	NT_187147	TCG	2	6	15568	15573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995032
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282	NT_187147	CGA	2	6	15844	15849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995032
283	NT_187147	GC	3	6	15851	15856	0 %	0 %	50 %	50 %	399995032
284	NT_187147	GCA	3	9	16021	16029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995033
285	NT_187147	ACA	2	6	16128	16133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995033
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290	NT_187147	TCG	2	6	16281	16286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995033
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292	NT_187147	CAG	2	6	16533	16538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995034
293	NT_187147	CAGC	2	8	16577	16584	25 %	0 %	25 %	50 %	399995034
294	NT_187147	CAG	2	6	16652	16657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995034
295	NT_187147	CTCGAT	2	12	16658	16669	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399995034
296	NT_187147	T	7	7	16669	16675	0 %	100 %	0 %	0 %	399995034
297	NT_187147	AGC	2	6	16715	16720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995034
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299	NT_187147	TTA	2	6	16833	16838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995035
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301	NT_187147	TCG	2	6	16863	16868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995035
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